Без проблем можно переехать 1.2 -> 1.3.
Если наоборот, то конфиг надо править ручками.
А можно узнать что добавлено вами в версию 1.2?
Ну, там по ссылке написано, что было добавлено.
Из основных - это multi-wan в начальной стадии и домен для PPTP-сервера.
столкнулся с проблемой 100% загрузки процессора
Попробуйте включить device polling.
Для IPSec, наверное, лучше использовать 1.3, там более новые библиотеки.
Не знаю, насколько хорошо будет работать на 1.2.
Можете поспрашивать тут:
http://forum.m0n0.ch/index.php/board,8.0.html